1、根據(jù)《國家稅務(wù)總局關(guān)于企業(yè)所得稅核定征收若干問題的通知》(國稅函〔2009〕377號)規(guī)定：匯總納稅企業(yè)不適用核定征收方式。因此，對于設(shè)立跨地區(qū)分支機構(gòu)的建筑業(yè)企業(yè)，其納稅方式和征收方式應(yīng)當妥善選擇，核定征收則無法適用匯總納稅，匯總納稅則不得核定征收。

2、根據(jù)《國家稅務(wù)總局關(guān)于企業(yè)所得稅核定征收有關(guān)問題的公告》(國家稅務(wù)總局公告2012年第27號)的規(guī)定，依法按核定應(yīng)稅所得率方式核定征收企業(yè)所得稅的企業(yè)，取得的轉(zhuǎn)讓股權(quán)（股票）收入等轉(zhuǎn)讓財產(chǎn)收入，應(yīng)全額計入應(yīng)稅收入額，按照主營項目（業(yè)務(wù)）確定適用的應(yīng)稅所得率計算征稅；若主營項目（業(yè)務(wù)）發(fā)生變化，應(yīng)在當年匯算清繳時，按照變化后的主營項目（業(yè)務(wù)）重新確定適用的應(yīng)稅所得率計算征稅。

也就是說，核定征收企業(yè)所得稅的建筑業(yè)企業(yè)，如果發(fā)生轉(zhuǎn)讓財產(chǎn)收入，不管會計上如何核算，無論是盈利還是虧損，均應(yīng)以全額收入作為計稅依據(jù)，按照主營項目適用的應(yīng)稅所得率計算征稅，否則將面臨涉稅風險。

3、對于一般計稅方法計稅項目較多的建筑業(yè)企業(yè)，選擇核定征收，有可能會多交企業(yè)所得稅。這是因為，一般計稅工程的進項稅額只有取得增值稅專用發(fā)票等合規(guī)扣稅憑證方能抵扣，但核定征收方式下的企業(yè)所得稅只跟開票收入有關(guān)，無關(guān)成本，無論其成本費用發(fā)生多少，扣稅憑證取得多少，其企業(yè)所得稅的應(yīng)納稅額都是一個定量。

4、盡管核定征收方式下，建筑業(yè)企業(yè)繳納的企業(yè)所得稅不再與發(fā)票等稅前扣除憑證掛鉤，但從會計核算的角度看，根據(jù)《會計法》的相關(guān)規(guī)定，辦理經(jīng)濟業(yè)務(wù)事項，必須填制或者取得原始憑證并及時送交會計機構(gòu)。部分建筑業(yè)企業(yè)，發(fā)生經(jīng)濟業(yè)務(wù)事項，無任何原始憑證或直接以白條入賬，存在違反《會計法》的風險。

5、根據(jù)現(xiàn)行個人所得稅法的相關(guān)規(guī)定，建筑業(yè)企業(yè)支付給個人的費用，只有「個體工商戶的生產(chǎn)經(jīng)營所得」和「對企事業(yè)單位的承包、承租所得」這兩類所得，無需代扣代繳個人所得稅，其他九類所得，無論是否屬于增值稅的征收范圍，建筑業(yè)企業(yè)均需履行代扣代繳義務(wù)。

筆者接觸的部分核定征收的建筑業(yè)企業(yè)，向個人支付費用時，認為無需取得發(fā)票作為企業(yè)所得稅扣除憑證，想當然的忽視了代扣代繳個人所得稅的問題，風險極大。

總之，企業(yè)所得稅的核定征收，只是針對企業(yè)所得稅這一個稅種，對于增值稅進項稅額的抵扣、會計核算的原始憑證、個人所得稅的代扣代繳義務(wù)等問題，仍然要引起重視。對于規(guī)模較大的建筑業(yè)企業(yè)，應(yīng)當通盤考慮，合理籌劃，選擇適用企業(yè)全流程、全業(yè)務(wù)、全稅種的征收方式。